Panindicuaro esta ubicado en Mexico en la Ciudad de Michoacan, Panindicuaro estaba habitado desde mucho antes de la llegada de los europeos, constituido en la frontera cultural entre purepechas y chichimecas. A nivel extrarregional era dependiente de Tzintzuntzan, el centro rector de toda la cultura de Michoacan. A nivel regional dependia de Tzacapu, la cabecera fronteriza; a nivel local Panindicuaro era una unidad organica, tenia su centro ceremonial, gobernado por un señor principal, Ademas Tzantzan, Carupo, Epejan y Aguanuato, cada uno tenia su propio gobernante y tributaban a sus senores locales, a Tzacapu y a Tzintzuntzan. El asentamiento de la poblacion era de tipo disperso, cada grupo familiar estaba asentado en su area de trabajo. Los nativos se ocupaban de la agricultura, caza, pesca y recolección, No tenian una especializacion de trabajo. La religion prehispanica fue un elemento de cohesion e impulso la construcción de diversos templos, conocidos con los nombres de yacatas.
Los primeros propietarios en Panindicuaro fueron los Villaseñor. Juan Villaseñor fue noble español, conquistador, visitador, encomendero y vecino de la ciudad de Mexico, quien en 1541 junto con Luis de Leon Romano y Juan de Alvardo fueron encomendados por el Virrey para que fundaran Valladolid, hoy Morelia.
En 1570 Panindicuaro era uno de los ocho barrios que iban a doctrinarse a Puruandiro, que era la cabecera a la cual estaba sujeta, no hay información exacta en que año salio del valle pero para 1583 el pueblo ya estaba hacentado en el lugar nombrado el "Janamo" con el nombre de San Andres Panindicuaro. Por lo abrupto del terreno el pueblo estaba disperso, por este motivo a principios del siglo XVII las autoridades espanolas por considerar no tener orden ni justicia y para controlar mejor a los naturales, opto por congregarlos, en contra de su voluntad a Santiago Conguripo y en esta forma para los religiosos se les facilito su evangelización.
En 1633 los naturales de San Andres Panindicuaro observaron que en Santiago Conguripo estaban descarriados y el pueblo se habia dispersado; de su libre y espontanes voluntad tomaron en acuerdo de volver al lugar de origen, de donde los habian sacado, y reconstruir su poblado con Iglesia y casas de justicia, tal como lo exigian las normas españolas. En total 21 familias regresaron a refundar a San Andres Panindicuaro. Hombres, mujeres, ninos y ancianos construyeron sus casas, ademas hicieron un hospital en donde tuvieron "a la Reina de los Angeles nuestra señora y al apostol San Andres", santos de su devocion.
En la segunda mitad del siglo XVIII los pueblos de la región de Panindicuaro quedaron organizdos en republica de naturales y nombraron un Alcalde, un Regidor, un Prioste o mayordomo del hospital, un Alguacil mayor encargado de vigilar el orden y aprehender a los delincuentes, un Fiscal mayor encargado de la doctrina, misas y fiestas religiosas, y un escribano de republica. Todos estaban bajo la supervisión de los viejos quienes formaban el comun de los naturales, y los elegian en forma anual. Su organizacion politica permanecio hasta el siglo XIX, en 1831 fue convertida en municipio de Panindicuaro y sus tenencias.
Para los años siguientes el pueblo evoluciono un poco, pues entre 1800 y 1850 el pueblo se componia de 4 manzanas; no fue si no hasta el año de 1870 cuando se vio un poco de progreso, se empezaron a sacar rectas las calles, pues para esa epoca el Pueblo se componia de callejones muy angostos.
El 28 de junio de1860, la cabecera municipal adquiere el titulo de Villa de Cajica. La epoca de mayor esplendor economico en el pueblo fue entre 1890 y 1910, ademas habia crecido el Municipio en el numero de habitantes, pues para ese periodo el Municipio alcanzo los 22,000 habitantes y al termino de la Revolucion solo contaba con 11,000 en todo el Municipio; la causa fue que muchos ricos comerciantes salieron a radicarse a Guadalajara y Mexico donde actualmente los descendientes de estos son grandes empresarios.
